Dúvida 
Por que somente o Certificado de tipo A1 foi homologado pela Senior para utilização na transmissão de XML do eSocial no módulo Administração de Pessoal?

Solução
Somente o responsável por transmitir os arquivos XML deverá ter o Certificado A1. 
Isso porque o sistema mensageiro (Documentos Eletrônicos eSocial) ficará logado com o sistema do governo o tempo todo, e se usar o A3 tem que ter alguém para digitar senha PIN, etc, o que nem sempre acontece, e o cliente pode com isto perder um prazo de envio, visto que no sistema Senior boa parte dos arquivos XML serão transmitidos automaticamente.

O sistema mensageiro ficará instalado apenas no Servidor de dados, e somente esta máquina efetuará os envios de XML ao eSocial.

Assim, os clientes do escritório contábil podem continuar utilizando o certificado A3 para passar a procuração ao Escritório, e apenas o Escritório deverá ter o certificado A1, porque estará com a posse do sistema mensageiro (Documentos Eletrônicos eSocial).

Esta não é uma questão legal, que envolva embasamento jurídico, mas sim, uma questão de tecnologia e facilidades ao cliente.