Ao calcular a folha ocorreu o erro para apenas um colaborador "Parâmetro PERREF não encontrado".

Rotina / Tela: Cálculos > Efetuar Cálculo - Log Processamento

Neste caso foi identificado que o colaborador possui duplo vínculo e em um dos vínculos estava informando a 2º matricula e no outro não informava nada, não fechando o círculo que as matrículas devem fazer.

Após corrigir e vincular corretamente o erro não ocorreu mais.