Colaborador possui outro contrato fora do sistema, onde no sistema é Empregado (categoria 101), com Base de Constribuição 2.724,67. Em Cálculos > Lançamentos > Base, possui o outro contrato (categoria 701) com Base de 2.500,00 e desconto de INSS 275,00, ao calcular a folha mensal descontou 11% de INSS = 299,71, ou seja, na folha ele somou as bases e aplicou 11%, no eSocial aplicou 9% gerando diferença no desconto no retornbo do S-5001.

Rotina / Tela: Cálculos > Efetuar Cálculo, eSocial > Eventos Periódicos > Envio da  Declaração Mensal.

Solução: Após análise verificamos que se o outro contrato é contribuinte individual (701), a alíquota do empregado não altera, apenas respeitará o teto.

No Lançamentos de Base, deverá indicar 'Sim' para Contribuinte Individual no respectivo campo. O sistema não verifica a Categoria eSocial.

Com esta orientação  não ocorrerá a diferença e calculará conforme eSocial.