Dúvida
Por que os valores dos pedidos e ordens de compra são zerados quando estes documentos são liquidados, no módulo de Mercado?
 

Solução
Este comportamento é padrão do sistema. Ao finalizar o faturamento de um pedido, onde o mesmo seja considerado Liquidado, todos os valores são zerados.

Isto porque, se mantivermos estes valores após liquidação, os mesmos poderão ser apresentados de forma indevida em relatórios e fluxos de caixa.
 
Mesmo conceito para Ordem de Compra, quando a mesma é liquidada (totalmente recebida), os valores são zerados.
 

Observação
Atualmente não há uma forma de customização para alterar este comportamento.