Ao cadastrar um cliente, seja via webservice cad.clientes porta GravarClientes ou pela tela F085CAD

sempre vem preenchido o valor do campo %Mora Mês/Tolerância e %Multa/Tolerância de forma automático, e no caso do webservices não foi preenchido os campos RecJmm e RecMul

De onde vem essa informação?

Rotina / Tela: WS Cad.Clientes porta GravarClientes ou tela F085CAD - Cadastros / Clientes e Fornecedores / Clientes / Cadastro

Solução: 

Existem duas possibilidades, a primeira é que está informado esses campos na filial do contas a receber, no caso tela F070FRE - Cadastros / Filiais / Parâmetros por Gestão / Contas a Receber guia Receber 1 campos %Mora Mês/Tolerância e %Multa/Tolerância

Porém se ali não tiver informação, então pode ser que esteja com o identificador de regras GER-085HCLVP01 ativo e com alguma regra.

Para verificação, entrar na tela F098REG - Cadastros / Identificadores e parâmetros / Identificador de Regras, e ver se tem o identificador com o campo Situação Ativo e uma regra informada.

Se tiver, é dali os valores que estão sendo preenchidos ao cadastrar um cliente.