Incidente
No módulo Gestão de Tributos, ao reapurar o ICMS com diferencial de alíquota, os valores retornam na tela duplicados:
 

 
Causa
Este incidente ocorre, pois a descrição do dispositivo fiscal não é igual a descrição padrão sugerida pela apuração.
 
No cálculo padrão o sistema insere o diferencial de alíquota no campo 13 - Outros Débitos (12) , e quando ocorre o recálculo, se ele não encontra um registro com a mesma descrição, ele insere outro deixando o valor duplicado.
 
Solução
Para que esse incidente não ocorra, realize os passos a seguir:
 
1. Acesse a tela F051DIS - Cadastros / Controladoria / Tributos / Dispositivos fiscais, e na coluna Descrição informe 'Diferencial de Alíquota':
 

 
2 - Acesse a tela F661PAI - Controladoria / Gestão de Tributos / Operações e Cálculos Fiscais / Cálculos / Apuração, delete os registros e informe somente uma linha com o valores corretos, depois reapure o imposto para garantir que corrigiu: