Dúvida
No módulo Contábil, o sistema está realizando a Contabilização de CTes cancelados.

Solução
Caso o CTe Cancelado, tenha gerado Origem para outro CTe como por exemplo um CTe Complementar, o CTe cancelado será contabilizado, pois CTE complementar normalmente se refere a complemento de valores e essa informação será levada para contabilização.

Atenção! Antes de realizar qualquer alteração, analise o impacto que poderá ter em outros lançamentos/processos do sistema.