No módulo Controle de NF-e, ao transmitir o cancelamento de uma nota fiscal de retorno e a ação for efetivada pela Sefaz, gerada a partir de um inventário, o saldo não esta retornando para o estoque.

Causa
Este incidente ocorre, pois para o inventário após atualização de estoque não existe contra fluxo.
Ou seja, a quantidade foi contada no inventário e dado baixa no estoque, é gerado uma nota de retorno.