Incidente
No módulo Suprimentos ao emitir a Nota fiscal não está integrando com a apuração do PIS/COFINS.

Causa
Este incidente ocorre, pois a parametrização dentro da transação não esta marcada. 

Solução
Para realizar a parametrização de soma, siga os passos abaixo:
 
1. Acesse o módulo SUP / Cadastros / Compras / Tipos de Transação de Compras:

 
2. Na guia Filtros, localize o código da transação da nota fiscal do recebimento;

2.1. Clique em Filtrar:

 
3. Acesse a aba Rodapé;

3.1. Marque a opção 'Somar o Valor da Substituição Tributária ao Valor Total'

3.2. Clique em Salvar Registro.