Incidente
Ao emitir uma NF-e é retornada a mensagem de rejeição Rejeição 539: Duplicidade de NF-e, com diferença na Chave de Acesso.
 
Causa
Esta mensagem é retornada quando for emitida uma Nota Fiscal Eletrônica na Sefaz que já possua outra Nota Fiscal Eletrônica já autorizada, contendo o mesmo CNPJ Emitente, Modelo, Série e Número, mas com, Data de Emissão, Tipo de Emissão ou Código Numérico ou outras posições da Chave de Acesso diferentes.
 
Solução
Para resolver a mensagem apresentada, é necessário algumas verificações iniciais, primeiramente deve-se entrar em contato com o setor Contábil da empresa, e solicitar que seja verifica quais numerações estão liberadas para emissão junto a SEFAZ, isto se faz necessário pois podem ocorrer emissões por outros sistemas, e ou, sistemas gratuitos do governo aos quais a Senior não possui acesso, o que consome a numeração de determinada serie para a SEFAZ. Feito essa verificação junto do setor Contábil, exclua o documento que esta rejeitado atualmente, e siga os passos abaixo:
 
1. Acesse o módulo CFG / Cadastros / Empresas:

2. Filtre a empresa emitente:

3. Clique na aba Faturamento, sub aba Notas Fiscais, na opção da Última Nota Fiscal Emitida preencha os parâmetros 'Série' e 'Num. Documento':

 
 
4. Altere a informação do campo Num. Documento, para o numero do ultimo documento referente a serie que esta emitido e autorizado na SEFAZ;
 
5. Após alteração acesse novamente a rotina do modulo FAT / Movimentações / Notas Fiscais / Notas Fiscais:

 
6. E emita o documento novamente.