Dúvida
Qual a diferença da variável global CodEmp e EmpAtu para uso nas regras em geral no módulo de Recursos?

Solução
A diferença é que a variável EmpAtu vem da tabela E099USU e busca o campo EmpAti, então é verificado o usuário e a empresa que são chaves dessa tabela:

Já o campo CodEmp não olha para o usuário e busca direto da E070EMP.CodEmp.

Basicamente tem a mesma finalidade.