Incidente
Ao tentar criar uma ocorrência finalizadora, é apresentado a mensagem: Linha de Cálculo não poderá ser excluído(a), pois está vinculado(a) em CTe

Causa
Esse incidente ocorre quando a configuração STPERMITEEXCLOCORR está ativa, ela permite que seja excluído Ocorrências de Acompanhamento, cujo o indicativo de entrega é "Andamento/Informativo, ao incluir uma ocorrência finalizadora.

Solução
Para que esse incidente não ocorra, é necessário que realize os passos a seguir:

1.Acesse o menu Operacional/ Configuração dos parâmetros do Sistema

2.Expanda a opção Ocorrências->Permite excluir Ocorrências de Acompanhamento, cujo o indicativo de entrega é (Andamento/Informativo), na inclusão de ocorrência finalizadora;
2.1 Selecione a opção Não e Salve o processo feito:

3.Dessa forma, o sistema não irá permitir que seja excluído ocorrências de acompanhamento ao incluir uma ocorrência finalizadora e consequentemente não gerará mais a crítica.