Incidente
No módulo EXP, rotina Emissão de Conhecimentos, ao gravar um CT-e o Tipo de Documento Fiscal é alterado indevidamente.
 

Causa
Este incidente ocorre pois, na Natureza de Operações vinculada ao Conhecimento está parametrizado um Tipo de Documento padrão. Portanto, sempre que utilizar esta Natureza de Operações o campo em questão será alterado na emissão do CT-e.
 

Solução
Para que o incidente não ocorra, execute os passos a seguir:

1. No módulo EXP, acesse Cadastros / Cadastros Gerais / Naturezas de Operação; 
1.1. Na aba Filtros, busque a Natureza desejada; 
1.2. Remova o conteúdo do campo Tipo Documento Fiscal; 
1.3. Grave a alteração.
 

Atenção! Antes de realizar qualquer alteração, analise o impacto que poderá ter em outros lançamentos/processos do sistema.