Incidente
No módulo EXP, rotina Emissão de Conhecimentos, ao gerar um CT-e é retornada a mensagem: A indicação do tomador do CTe de substituição deve ser igual à do CTe substituído.
 

Causa
Esta mensagem é retornada pois, o CT-e de Substituição gerado está possui o Tomador diferente de Expedidor (0).
 

Solução
Para que o incidente não ocorra, é necessário referenciar o Tomador do frete no campo Exp. Carg. (Expedidor da Carga). Desta forma o documento será autorizado normalmente:

Atenção! Antes de realizar qualquer alteração, analise o impacto que poderá ter em outros lançamentos/processos do sistema.