Dúvida
CTE emitido indevidamente e fora do prazo de cancelamento, como ajusta-lo no GKO para que não fique vinculado a fatura ou ocorra contabilização?

Solução
Para ajuste do CTE no GKO para que não fique vinculado a fatura, realize os passos a seguir:

1. Acesse a Fatura através do menu Exibir/ Fatura / Fatura;
2. Acesse a aba de Conhecimento, e depois clique no ícone de seleção conforme destacado abaixo: 

3.Dê um duplo clique na linha do CTE que deseja excluir e salve:

1. 4.Acesse novamente o CTE que desvinculou da fatura, através do menu Exibir / CTE / CTE:
   

2. 5.Clique no ícone de lixeira para excluir o CTE, porém caso não seja possível excluir o CTE, altere o status do fechamento fiscal para "CANCELADO" e salve:

6.Caso tenha incluído desconto na fatura referente a esse CTE, remove-lo e recalcular a fatura.