Dúvida
Como cancelar um CT-e que possui MDF-e autorizado, no módulo Expedição?

Solução
Para cancelar o CT-e com MDF-e autorizado execute os passos a seguir:

1. Cancele o MDF-e;

1.1. Acesse a rotina Movimentações / MDFe (Manifesto Eletrônico):

2. Na guia Filtros, pesquise pelo MDF-e desejado;
2.1. Clique no botão Cancelamento:

2.2. Na mensagem de confirmação clique na opção SIM:

2.3. Informe uma justificativa para o cancelamento e clique em OK:

3. Efetue o cancelamento do Cte;

3.1. Acesse a rotina Movimentações / Conhecimentos / Manutenção:

3.2. Na rotina de Manutenção de Conhecimentos, pesquise pelo CT-e desejado (Empresa / Número / Tipo de Documento):

3.3. Clique no botão Cancelar Registro;
3.4. Na mensagem de confirmação clique em SIM:

3.5. Informe o Motivo de Cancelamento;
3.5. Informe a Observação (mínimo de 15 caracteres);
3.6. Clique em OK.

• Observação: 
  O prazo para cancelamento de CT-e com MDF-e autorizado é de 24h após a autorização;
  O prazo para cancelamento de CT-e sem MDF-e autorizado é de 168 horas após a autorização.
• Se o MDF-e estiver ENCERRADO, o cancelamento não poderá ser realizado;
  Se for notificada circulação da carga no documento fiscal, o cancelamento não poderá ser realizado.

Atenção! Antes de realizar qualquer alteração, analise o impacto que poderá ter em outros lançamentos/processos do sistema.