Incidente
No módulo Vendas, ao tentar processar retorno de cobrança é apresentada a mensagem:
Não será possível receber.
Obra: XX
Venda: XX
Tipo: XX
Motivo: Essa parcela é uma antecipação, e as datas são diferentes.
Utilize o assistente de recebimento para efetuar a baixa.

Causa
Esta mensagem é apresentada, pois o boleto foi pago após a data de antecipação.

Solução
Para que a mensagem não seja apresentada ao tentar processar retorno de cobrança, realize os passos a seguir:
1. No módulo Vendas, acesse Geral / Empresa / Cadastro:

2. No folder Config. Fiscais, clique em Configurações fiscais:

 
3. No folder Vendas, marque a flag Permitir receber boletos gerados de forma antecipada (valor presente) mas que foram pagos pelo cliente após sua data de vencimento / Clique em Sair:

 
4. Clique em Gravar: